战舰上尘封在初号机里14年的真嗣终于苏醒过来,与美里、律子、明日香还有东治的妹妹再eee。众人口中,真嗣得知自己已沉睡14年,但他发现明日香却一点也没有变化。与此同时,战舰受到EVA的袭击,陆地上,明日香找到真嗣的控制舱,舱内的真嗣再度进入自闭状态,明日香只好拽着真嗣走。此时丽也出现,于是三人一起走向远方。